W skład kolekcji wchodzą przedmioty związane z życiem i twórczością Alfonsa Karnego. Są to zarówno obiekty będące własnością muzeum, jak i depozyty. Do zbioru zaliczamy obrazy, fotografie, ceramikę, meble, grafikę, a także dokumenty. Do najcenniejszych należą prace Olgi Niewskiej, Stanisława Noakowskiego, Antoniego Olesińskiego, Aleksandra Augustynowicza i wielu innych artystów związanych ze środowiskiem warszawskim. Dopełnienie kolekcji stanowi zgromadzone wyposażenie warsztatu prezentowane w formie zaaranżowanej pracowni artysty.
